En plus d'être le second plus grand ensemble d'herbiers de zostères de France (après le bassin d'Arcachon), ainsi qu'un site d'hivernage et de migration majeur en Europe pour les oiseaux d'eau, le golfe présente une remarquable diversité d'habitats marins et littoraux qui lui ont valu sa désignation en ZSC. Le site vaut notamment par la présence d'un important étang eutrophe comportant des groupements très caractéristiques ainsi que des espèces rares (étang de Noyalo). Les fonds marins rocheux abritent une faune et une flore remarquable par la diversité des modes d'exposition aux courants (mode très abrité à très battu, courants de marée très puissants). L'ensemble de la rivière de Noyalo et de ses dépendances constitue un habitat fonctionnel remarquable pour le second plus important noyau de population de Loutre d'Europe de Bretagne. Quatre espèces de chiroptères d'intérêt communautaire fréquentent également le site.

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Représentation surfacique des principaux milieux naturels de la ZSC du golfe du Morbihan , côte Ouest de Rhuys :
- Mer, Bras de Mer, 37 %
-Rivières et Estuaires soumis à la marée, Vasières et bancs de sable, Lagunes, 25 %
-Prairies semi-naturelles humides, Prairies mésophiles améliorées,10 %
-Autres terres arables, 8 %
-Marais salants, Prés salés, Steppes salées, 6 %
-Galets, Falaises maritimes, Ilots, 5 %
-Dunes, Plages de sables, 2 %
-Eaux douces intérieures (Eaux stagnantes, Eaux courantes), 2 %
-Landes, Broussailles, Recrus, Maquis et Garrigues, 2 %
-Marais (végétation de ceinture), Bas-marais, Tourbières, 2 %
-Forêts caducifoliées, 1 %
Habitats prioritaires et habitats d'interêt communautaire présent dans la ZSC du golfe du Morbihan, côte Ouest de Rhuys :
Les habitats considérés comme prioritaires sont en gras et marqués d'une*.
Les codifications à 4 chiffres correspondent aux codes UE.
Pour chaque habitats de la directive, des liens associés aux références européennes sont proposés. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Bancs de sable fin à faible couverture permanente d'eau marine 1110. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Estuaires 1130, herbiers de zostères naines. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Replats boueux ou sableux exondés à marée basse 1140, herbiers de zostères marines. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Lagunes côtières 1150*. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Grandes criques et baies peu profondes 1160. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Récifs 1170. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Végétation annuelle des laisses de mer 1210. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Végétation vivace des hauts de plage 1220. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Falaises avec végétation des côtes atlantiques et baltiques 1230. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Végétations pionnières à Salicornia et autres espèces annuelles des zones boueuses et sableuses 1310. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Prés à Spartina (Spartinion maritimae) 1320. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Prés salés atlantiques (Glauco-Puccinellietalio maritimae) 1330. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Prairies subhalophiles thermo-atlantiques 1410. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Fourrés halophiles 1420. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Dunes mobiles embryonnaires 2110. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Dunes mobiles à Oyat 2120. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Dunes côtières fixées à végétation herbacée (dunes grises) 2130*. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Végétations amphibies oligotrophes 3110. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Lacs eutrophes naturels avec végétation du Magnopotamion ou Hydrocharition 3150. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Landes humides atlantiques tempérées à Erica ciliaris et Erica tetralix 4020*. Pour plus d'infos, cliquez ici
-Landes sèches européennes 4030. Pour plus d'infos, cliquez ici
Espèces végétales visées par la Directive "Habitats, faune, flore" de la ZSC du golfe du Morbihan , côte Ouest de Rhuys :
Flûteau nageant - Luronium natans (L.) Rafin. Pour plus d'infos, cliquez ici
Oseille des rochers - Rumex rupestris Le Gall. Pour plus d'infos, cliquez ici
Trichomanes remarquable - Trichomanes speciosum Willd. Pour plus d'infos, cliquez ici
Invertébrés visés par la Directive "Habitats, faune, flore" de la ZSC du golfe du Morbihan , côte Ouest de Rhuys :
Agrion de Mercure - Coenagrion mercuriale. Pour plus d'infos, cliquez ici
Damier de la succise - Euphydryas aurinia. Pour plus d'infos, cliquez ici
Lucane cerf-volant - Lucanus cervus. Pour plus d'infos, cliquez ici
Grand capricorne - Cerambyx cerdo. Pour plus d'infos, cliquez ici
Mammifères visés par la Directive "Habitats, faune, flore" de la ZSC du golfe du Morbihan , côte Ouest de Rhuys :
Grand rhinolophe - Rhinolophus ferrumequinum. Pour plus d'infos, cliquez ici
Petit rhinolophe - Rhinolophus hipposideros. Pour plus d'infos, cliquez ici
Grand murin - Myotis myotis. Pour plus d'infos, cliquez ici
Loutre d’Europe – Lutra lutra. Pour plus d'infos, cliquez ici
